129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1806 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 104 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  55.77 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  65.56 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  51.96 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  50.96 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  53.92 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  54.55 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  51.11 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  45.36 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  48.48 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  49.49 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  43 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  46.53 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  46.53 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  60.87 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  42.57 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  44.12 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  43.14 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  54.24 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  39.56 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  39.56 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  34 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  39.19 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  43.04 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35.24 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.07 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  55 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  37.35 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.14 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  40.28 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  40.32 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  32.88 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  33.8 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  39.44 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  37.66 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  28.99 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  38.57 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.94 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  33.8 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  41.54 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.46 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  40.35 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  34.25 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.39 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  31.94 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  27.5 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  43.1 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  39.29 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.73 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.82 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  40.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>