96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1178 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  56.12 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  52.04 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  47.96 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  54.44 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  46.05 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  44.12 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.8 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  39.18 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  35.05 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.53 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  37.88 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  39.22 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.84 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.97 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  29.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  29.07 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.18 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  31.25 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30.68 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.29 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  29.87 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  36.51 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  36.51 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  44.68 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  29.87 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.59 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  29.69 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  29.79 
 
 		 129 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  27.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 96 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1484  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  27.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  27.55 
 
 		 96 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.53 
 
 		 110 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  46.15 
 
 		 76 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  29.69 
 
 		 270 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  37.18 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  30.65 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 254 aa  40.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  24.73 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  44.68 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 169 aa  40  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  27.55 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>