50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2793 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  41.58 
 
 		 104 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  37.11 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  36.84 
 
 		 105 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 86 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 103 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  32.99 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  27.18 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  27.48 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 98 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 99 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  27.59 
 
 		 109 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  25.71 
 
 		 115 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.1 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  38.98 
 
 		 121 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 101 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 109 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 100 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 102 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  27.55 
 
 		 100 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.91 
 
 		 101 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 102 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 96 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 98 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  26.47 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 98 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 98 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 115 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.94 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  22.99 
 
 		 97 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32.31 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  27.27 
 
 		 96 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 106 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  29.41 
 
 		 103 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>