105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2968 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  61.54 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  50.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  49.54 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  53.92 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  46.46 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  46.46 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  48.08 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  46.39 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  41.75 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  41.75 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  44.23 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  46.74 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  42.16 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  42.16 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  45.33 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  35.79 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  28 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  27.18 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  29.59 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  29.47 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  29.47 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  38.81 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  31.33 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.11 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  44 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  31.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  36.11 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.17 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  30.86 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  31.43 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  25.88 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  37.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  29.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  41.43 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  29.35 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  35.59 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  31.33 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  28.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  31.82 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  30.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  27.78 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  25.35 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  35.48 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 		 96 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  28.41 
 
 		 108 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  27.5 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  37.1 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  28.79 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  26.51 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  31.88 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  28.81 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>