90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2453 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 109 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  95.41 
 
 		 109 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  50.5 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  52.25 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  42.42 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  42.42 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  49.49 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  46.32 
 
 		 110 aa  97.1  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  41.75 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  46.79 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  42.57 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  44.76 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  43.81 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  39.8 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  42.27 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  49.33 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  39.39 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  39.62 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.96 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  27.45 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 102 aa  57  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  29.9 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  29.29 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  40.43 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  35.42 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  38.57 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.65 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  35.05 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  39.71 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  37.35 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.88 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  34.85 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  36.62 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.86 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  34.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  39.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  29.27 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  35.82 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  29.87 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  31.34 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.06 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  31.51 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  30.12 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  28.92 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  30.68 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.18 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>