140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1113 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 109 aa  216  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  78.1 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  59.79 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  50.59 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  40.85 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  45.35 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  47.54 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  43.06 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  40.86 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.36 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  37.21 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  29.79 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  41.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.58 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  30.21 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  37.93 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  44.59 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  36.05 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  46.55 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.63 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  37.36 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.18 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  36.17 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  34.57 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  41.98 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  38.67 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.47 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  37.68 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  30.93 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  30.61 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  27.96 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  41.54 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>