90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3538 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  56.12 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  55.1 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  51.02 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  41.24 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  39.77 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  35.05 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  42.05 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  47.46 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  37.18 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  41.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.52 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.13 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  31.11 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.04 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  28.74 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  36.26 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  35.21 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  42.59 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  30.67 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  29.58 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  30.99 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  30.99 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  32.58 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 116 aa  42  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  30.38 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  27.85 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.63 
 
 		 101 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  27.5 
 
 		 126 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  31.46 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 108 aa  40.8  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  34.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.26 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.44 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  35.44 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  30.88 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>