9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2353 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  47.5 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 98 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  62.96 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 189 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>