37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1861 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.56 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.43 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.83 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  21.05 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  23.62 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.23 
 
 		 271 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  31.9 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  30.09 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.94 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  29.17 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.15 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  27.96 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  37.11 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  27.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  32.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  27.83 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  26.61 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  26.61 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  25.22 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  28.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  21.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  29.69 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  26.32 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  38.3 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  54.29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 132 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>