31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2734 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  50.72 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  41.46 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  42.02 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  38.26 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  37.39 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  42.47 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  34.45 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.41 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  30.09 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  29.46 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  27.13 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.57 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  34.82 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  52.5 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  29.75 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 124 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  33.94 
 
 		 137 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  64.29 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  25.9 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  22.52 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.76 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  48.65 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  28.91 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0392  hypothetical protein  29.08 
 
 		 143 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 144 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>