47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0763 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  87.41 
 
 		 148 aa  254  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  49.59 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  41.27 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  42.02 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  33.59 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30.37 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  34.75 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.09 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.67 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  27.43 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.82 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  32.39 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  29.31 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  22.46 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  26.52 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  26.76 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  28.26 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  24.82 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  30.6 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.75 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  26.15 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  31.19 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  29.06 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>