61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3654 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  79.49 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  37.61 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  28.93 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  33.04 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  34.43 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  35.34 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  24.58 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.38 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.48 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  30.51 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  36.84 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  36.84 
 
 		 295 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  36.84 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  38.66 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  25.6 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  34.26 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  32.43 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  34.75 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  30.56 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.97 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.08 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  32.48 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.66 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  36.76 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  26.55 
 
 		 123 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  30.08 
 
 		 148 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  28.44 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  80 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  35.71 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  36.92 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  38.03 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  80 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  25.47 
 
 		 110 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 132 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  33.61 
 
 		 140 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>