57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0893 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  39.55 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  37.31 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  37.31 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  42.42 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  35.25 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.6 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  38.52 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  39.67 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  38.84 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  36.22 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  32.12 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  27.46 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  33.85 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  33.59 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  30.37 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  32.29 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  41.51 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  48.89 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.66 
 
 		 271 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  30.83 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  40.91 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  33.04 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  33.75 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  51.28 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.23 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.66 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  36.17 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32.76 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 156 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 99 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.95 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  42.55 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  28.97 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  32.18 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  36.59 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  43.18 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  29.03 
 
 		 99 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>