47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5679 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  94.81 
 
 		 135 aa  263  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  52.27 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  54.2 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  50.78 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  38.14 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  39.52 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  34.23 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.68 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  32.31 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.32 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  27.52 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.43 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  25.44 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  35.14 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  28.89 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  31.13 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  32.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  23.44 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.13 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  40.54 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  28.72 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.7 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36.49 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  27.03 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>