58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1589 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  83.33 
 
 		 139 aa  223  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  83.33 
 
 		 139 aa  220  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  72.44 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  55.38 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  56.56 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  47.93 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  42.31 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  41.89 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  41.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  35.34 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.74 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  36.99 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  39.05 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.58 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  44.07 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  47.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  28.15 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30.23 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  31.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  31.3 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  31.71 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  27.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  34.21 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  41.27 
 
 		 269 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  31.85 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  26.09 
 
 		 129 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>