39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5656 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  58.24 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  57.85 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  56.81 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  56.81 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  62.75 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  60.54 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  59.32 
 
 		 327 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  44.36 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  46.78 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  46.78 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  43.97 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  40.08 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  41.25 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  41.07 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  66.37 
 
 		 136 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  36.36 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  51.97 
 
 		 151 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  33.47 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  37.74 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  36.68 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  57.29 
 
 		 131 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  27.34 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  30.25 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  23.43 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3269  DNA polymerase beta domain protein region  26.34 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  19.62 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  28.09 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  26.05 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  23.83 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>