30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4803 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  58.55 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  49.54 
 
 		 278 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  45.54 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  43.38 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  42.86 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  39.15 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  39.15 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  38.68 
 
 		 289 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  38.68 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  39.15 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  38.79 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  38.79 
 
 		 263 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  38.6 
 
 		 263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  38.01 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  38.73 
 
 		 327 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  32.91 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  39.62 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  38.64 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  35.05 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  24.88 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  36.67 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  23.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>