33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1735 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  46.99 
 
 
260 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  43.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  44.12 
 
 
260 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  41.34 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  49.54 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  41.07 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  35.34 
 
 
263 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  35.34 
 
 
267 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  40.72 
 
 
295 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  38.36 
 
 
335 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  37.72 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  37.04 
 
 
289 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  37.04 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  39.35 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  36.57 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  36.11 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  38.84 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  36.71 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  35.87 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  24.65 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  28.24 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  29.94 
 
 
151 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  39.02 
 
 
136 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  27.73 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  30.93 
 
 
131 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  21.83 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>