25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3372 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  100 
 
 		 131 aa  262  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  84.85 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  65.66 
 
 		 327 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  56.45 
 
 		 263 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  57.29 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  42.62 
 
 		 267 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  42.62 
 
 		 263 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  46.9 
 
 		 263 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  46.9 
 
 		 335 aa  103  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  51.52 
 
 		 295 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 272 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  36.11 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  38.38 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  38.38 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  38.38 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  37.37 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  36.9 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  30.93 
 
 		 278 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>