35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2105 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  100 
 
 
263 aa  520  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  79.39 
 
 
327 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  58.7 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  57.48 
 
 
263 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  60.54 
 
 
269 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  56.28 
 
 
267 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  56.28 
 
 
263 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  55.08 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  48.5 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  48.07 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  48.07 
 
 
289 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  48.07 
 
 
289 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.35 
 
 
260 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  36.72 
 
 
260 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  63.16 
 
 
151 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  33.89 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  38.84 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  56.45 
 
 
131 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  52.68 
 
 
136 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  33.08 
 
 
284 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  35.19 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  34.1 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  23.27 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  32.2 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  24.55 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  22.5 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  34.33 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>