12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3186 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  28.88 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  28.72 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  27.67 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  24.69 
 
 		 327 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  20.54 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  20.54 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  22.82 
 
 		 263 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  19.62 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  18.78 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  18.78 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>