42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0068 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  26.57 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  27.11 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  25.96 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  25.89 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  24 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  23.61 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.79 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  25.19 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5084  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.61 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  24.23 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5054  nucleotidyltransferase domain protein  23.81 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5090  nucleotidyltransferase domain protein  23.71 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  23.81 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  26.6 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  26.6 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  26.6 
 
 
289 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  26.11 
 
 
289 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  23.33 
 
 
292 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2432  hypothetical protein  22.97 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5184  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.2 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4819  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.2 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  21.83 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  23.48 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3295  DNA polymerase beta domain protein region  23.63 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3552  nucleotidyltransferase  38.81 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  22.86 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0150  nucleotidyltransferase domain protein  23.2 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  24.42 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  24.42 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2692  DNA polymerase, beta-like region  25 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.615413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  23.83 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  22.46 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  24.43 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0296  DNA polymerase beta domain protein region  22.17 
 
 
271 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>