39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2488 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  27.65 
 
 
601 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4769  DNA polymerase beta subunit  26.13 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3552  nucleotidyltransferase  26.24 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  24.56 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0150  nucleotidyltransferase domain protein  24.32 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4819  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.68 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  27.12 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5184  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.68 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5054  nucleotidyltransferase domain protein  23.68 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5084  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.28 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5090  nucleotidyltransferase domain protein  24.32 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  23.25 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  25.96 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  23.25 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  26.39 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  25.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  26.07 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  27.13 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  26.67 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  24.9 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0296  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  23.15 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  29.15 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  22.43 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  19.57 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  25.11 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  26.29 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  28.09 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  25.96 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  25.96 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  25.53 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2432  hypothetical protein  25.57 
 
 
269 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>