67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0364 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  38.14 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  40.6 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  34.03 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  34.19 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  36.07 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.62 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  35.34 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.93 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  33.05 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  33.05 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.83 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.09 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  27.46 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.09 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  29.2 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  35.09 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.36 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  24.64 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  31.67 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.84 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  31.06 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  28.45 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  31.43 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  25 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  28.07 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  27.34 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 241 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.2 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  26.83 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  23.2 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  29.91 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  27.84 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  33.03 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  36.47 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  26.45 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  31.46 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  25.64 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  28.28 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  26.27 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  27.66 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  27.68 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  30.61 
 
 		 109 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>