20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2738 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 109 aa  222  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  35.24 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  40.82 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  27.96 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  45.65 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  51.02 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  43.18 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  59.38 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  26.26 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 100 aa  40.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  62.07 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  35.62 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  58.06 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>