83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1075 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  61.48 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  60.8 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  53.72 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  35.43 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.5 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.58 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  34.23 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  37.27 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  32.43 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  41.09 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  28.35 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  47.22 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.52 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  43.02 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  41.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  31.09 
 
 		 167 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.53 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  38.54 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  33.6 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  39.05 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  33.96 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  32.2 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  35.63 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  30 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  29.7 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  30 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  30.88 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  37.93 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  31.9 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  31.75 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  27.66 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  24.47 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  25.49 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  25.4 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  25.4 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  52.5 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  26 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  27.35 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  34.25 
 
 		 100 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  42.22 
 
 		 105 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.46 
 
 		 295 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 137 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  28.26 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  27.08 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  28.28 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  32.76 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  46.81 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  36.07 
 
 		 936 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  41.07 
 
 		 102 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>