37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0897 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  47.56 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  39.08 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  31.11 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  32.88 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  30.3 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  26.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  29.81 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  36.92 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  26.53 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  26.55 
 
 		 137 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  24.32 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.41 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  38.3 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>