56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4901 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  67.27 
 
 		 110 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  28.7 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  32.61 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  51.02 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  53.06 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  29.7 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.21 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  26.21 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.87 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  27.84 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  28.26 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  28.26 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.26 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  38.64 
 
 		 289 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  60 
 
 		 274 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  65.52 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.37 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  38.96 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  44.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  25 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.48 
 
 		 105 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  28.43 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  45.1 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  51.16 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  48 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  36.47 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  55.81 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  46.88 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  46.88 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  48.89 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  37.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>