43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3842 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  36.7 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  40.71 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  36.36 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  26.92 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  32.41 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  30.36 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.35 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  30.39 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  27.18 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  32.69 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  32.69 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  32.99 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.69 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  34.51 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  41.54 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  31.13 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  51.28 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  25.84 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  34.12 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  27.62 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0132  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  27.27 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  25.86 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  25.86 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 100 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>