31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1359 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  100 
 
 		 134 aa  276  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  98.51 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  29.13 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0404  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  36.07 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  28.28 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  25.86 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  45.83 
 
 		 96 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  43.1 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.97 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  32.81 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  27.47 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 103 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>