21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2490 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.2 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  34.26 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  30.56 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  28.07 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  33.93 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  26 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  31.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.78 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.56 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.02 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  28.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  26.72 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>