34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0251 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 110 aa  215  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  54.9 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  57.61 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  53.09 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  46.91 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  38.38 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  37.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  43.94 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  32.88 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  28.75 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  35.09 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  43.18 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  29.52 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  44.26 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  55.88 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  32.81 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  32.81 
 
 		 134 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 107 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  64.29 
 
 		 100 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.69 
 
 		 132 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>