19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0336 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  42.73 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  33.03 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  44.16 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0681  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.784875  normal  0.848355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  48.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  28 
 
 		 111 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  40.38 
 
 		 106 aa  40  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  36.21 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>