19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3091 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  30.21 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  39.62 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  29.59 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  31.18 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  30.11 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 122 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>