42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0145 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  51.96 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  46.59 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  47.06 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  29.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  29.57 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  54.35 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  36.49 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  36.49 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  40.68 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  29.59 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  37.8 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  33.87 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  29.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  32.63 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  37.29 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48.39 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  36.47 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.23 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  56.76 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  35.82 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  27.78 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  26.32 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  32.53 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  36.92 
 
 		 107 aa  40  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  52.63 
 
 		 111 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  37.7 
 
 		 85 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>