31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4067 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
110 aa  216  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  70.64 
 
 
107 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13820  Nucleotidyltransferase domain protein  37.18 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  46 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.58 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  54.29 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  27.38 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  37.25 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  37.78 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  30.21 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  32.89 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  31.48 
 
 
140 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 
105 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  47.73 
 
 
53 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0669  DNA polymerase, beta-like region  43.14 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558725  normal  0.557112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0657046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>