19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1812 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  80 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  50.62 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  29.55 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  33.85 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1392  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 107 aa  42  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.206077  normal  0.55899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  28.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  30.86 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  40.38 
 
 		 122 aa  40  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>