17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1536 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  50.62 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  45.07 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  43.94 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  84.62 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  35.82 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  41.03 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  30.67 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  41.1 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  36.07 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  36.92 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 122 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>