17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1301 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  80.18 
 
 		 111 aa  184  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  39.6 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  38.3 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  32.41 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  29.67 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  34.86 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  30.67 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  29.55 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  36.05 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  31.19 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  24.53 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>