54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0997 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
115 aa  233  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  48.54 
 
 
117 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  50.98 
 
 
115 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  44.05 
 
 
191 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  38.83 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  35.51 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  37.29 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  34.31 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  39.18 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  33.91 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  35.64 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  36.63 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 
106 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  35.79 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  34.51 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.93 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  34.58 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 
105 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  32.04 
 
 
111 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  33.93 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.01 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  38.67 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  44.26 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.07 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  26.32 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 
137 aa  42  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0404  nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.67 
 
 
148 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  39.66 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  24.53 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  35.29 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  46.94 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 
122 aa  40  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.58 
 
 
110 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>