49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1020 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  51.55 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  42.71 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  51.55 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  43.14 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  47.96 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38.61 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.16 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  40.59 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  38.3 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  36.08 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  38.24 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  41 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.68 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  37.86 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  34 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  38.46 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  38.46 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  26.83 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  24.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.56 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  36.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  31.37 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.34 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.37 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  31 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  31 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  55 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>