29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0515 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  41.44 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3062  DNA polymerase, beta-like region  32.08 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  29.07 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  30.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  37 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  39.06 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.52 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  35.82 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  37.38 
 
 		 116 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  33.91 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  30.28 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.94 
 
 		 132 aa  40  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>