32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4091 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  43.81 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  42.2 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  39.62 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  39.6 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  35.58 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  41.9 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  37.65 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  37.37 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  27.59 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  30.61 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0494  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  28.83 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>