39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2571 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  41 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3062  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  41.44 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  27.45 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  38.18 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3919  DNA polymerase beta subunit  46.27 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  36.97 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  39.51 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  42.17 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  32.11 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  40.98 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  33.62 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  36.92 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  43.59 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  29.73 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0064  hypothetical protein  45.1 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.262773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  33.03 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32.69 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  54.84 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  29.31 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  28.7 
 
 		 114 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.14 
 
 		 101 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  40.38 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  48.94 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  28.87 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  36.9 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>