24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0323 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  91.38 
 
 		 116 aa  209  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0320  hypothetical protein  88 
 
 		 260 aa  94.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000112261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0988  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0677901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  37.86 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  27.18 
 
 		 112 aa  42  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  51.35 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  36.23 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  45.65 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  32.46 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  40.91 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  59.38 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.42 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>