44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1044 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  55 
 
 		 125 aa  153  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  43.18 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  54.55 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  29.59 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  29.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  33.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  44.19 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  47.37 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  59.38 
 
 		 111 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 132 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  28.03 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  31.03 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2007  nucleotidyltransferase  30.61 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00118727  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0385  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  64.29 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2659  nucleotidyltransferase  25.89 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.699259  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1137  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.171922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4026  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  51.22 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  48.89 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  47.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 115 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>