35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2316 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 155 aa  300  6.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  44.93 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  29.84 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  28.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  48.84 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  47.54 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  45.61 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  60.71 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  60 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  43.4 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  25.47 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 303 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  46.34 
 
 		 732 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.73 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1449  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  44.19 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 116 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  69.23 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 96 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  59.38 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  38.96 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  56.25 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  44.12 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  53.66 
 
 		 106 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  32.73 
 
 		 111 aa  40.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>