14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0596 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 174 aa  347  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  51.76 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  44.93 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  33.58 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  29.53 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  28.07 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.31 
 
 		 97 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1449  hypothetical protein  28.32 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  36.56 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  48 
 
 		 111 aa  41.2  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  28.03 
 
 		 122 aa  41.2  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>