11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3917 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1449  hypothetical protein  43.94 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  33.58 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  29.84 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 116 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  27.69 
 
 		 154 aa  45.1  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  54.29 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  59.38 
 
 		 127 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 114 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>