13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0883 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  26.09 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  29.55 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3917  hypothetical protein  27.69 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.038879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  32.47 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  54.84 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2779  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4770  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  decreased coverage  0.0000169351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>